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biospecifics生物股票成交量

發布時間:2021-04-18 07:46:18

❶ 生物化學名詞解釋英文版

第一章
1,氨基酸(amino acid):是含有一個鹼性氨基和一個酸性羧基的有機化合物,氨基一般連在α-碳上。
2,必需氨基酸(essential amino acid):指人(或其它脊椎動物)(賴氨酸,蘇氨酸等)自己不能合成,需要從食物中獲得的氨基酸。
3,非必需氨基酸(nonessential amino acid):指人(或其它脊椎動物)自己能由簡單的前體合成
不需要從食物中獲得的氨基酸。
4,等電點(pI,isoelectric point):使分子處於兼性分子狀態,在電場中不遷移(分子的靜電荷為零)的pH值。
5,茚三酮反應(ninhydrin reaction):在加熱條件下,氨基酸或肽與茚三酮反應生成紫色(與脯氨酸反應生成黃色)化合物的反應。
6,肽鍵(peptide bond):一個氨基酸的羧基與另一個的氨基的氨基縮合,除去一分子水形成的醯氨鍵。
7,肽(peptide):兩個或兩個以上氨基通過肽鍵共價連接形成的聚合物。
8,蛋白質一級結構(primary structure):指蛋白質中共價連接的氨基酸殘基的排列順序。
9,層析(chromatography):按照在移動相和固定相 (可以是氣體或液體)之間的分配比例將混合成分分開的技術。
10,離子交換層析(ion-exchange column)使用帶有固定的帶電基團的聚合樹脂或凝膠層析柱
11,透析(dialysis):通過小分子經過半透膜擴散到水(或緩沖液)的原理,將小分子與生物大分子分開的一種分離純化技術。
12,凝膠過濾層析(gel filtration chromatography):也叫做分子排阻層析。一種利用帶孔凝膠珠作基質,按照分子大小分離蛋白質或其它分子混合物的層析技術。
13,親合層析(affinity chromatograph):利用共價連接有特異配體的層析介質,分離蛋白質混合物中能特異結合配體的目的蛋白質或其它分子的層析技術。
14,高壓液相層析(HPLC):使用顆粒極細的介質,在高壓下分離蛋白質或其他分子混合物的層析技術。
15,凝膠電泳(gel electrophoresis):以凝膠為介質,在電場作用下分離蛋白質或核酸的分離純化技術。
16,SDS-聚丙烯醯氨凝膠電泳(SDS-PAGE):在去污劑十二烷基硫酸鈉存在下的聚丙烯醯氨凝膠電泳。SDS-PAGE只是按照分子的大小,而不是根據分子所帶的電荷大小分離的。
17,等電聚膠電泳(IFE):利用一種特殊的緩沖液(兩性電解質)在聚丙烯醯氨凝膠製造一個pH梯度,電泳時,每種蛋白質遷移到它的等電點(pI)處,即梯度足的某一pH時,就不再帶有凈的正或負電荷了。
18,雙向電泳(two-dimensional electrophorese):等電聚膠電泳和SDS-PAGE的組合,即先進行等電聚膠電泳(按照pI)分離,然後再進行SDS-PAGE(按照分子大小分離)。經染色得到的電泳圖是二維分布的蛋白質圖。
19,Edman降解(Edman degradation):從多肽鏈游離的N末端測定氨基酸殘基的序列的過程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾,然後從多肽鏈上切下修飾的殘基,再經層析鑒定,餘下的多肽鏈(少了一個殘基)被回收再進行下一輪降解循環。
20,同源蛋白質(homologous protein):來自不同種類生物的序列和功能類似的蛋白質,例如血紅蛋白。
第二章
1,構形(configuration):有機分子中各個原子特有的固定的空間排列。這種排列不經過共價鍵的斷裂和重新形成是不會改變的。構形的改變往往使分子的光學活性發生變化。
2,構象(conformation):指一個分子中,不改變共價鍵結構,僅單鍵周圍的原子放置所產生的空間排布。一種構象改變為另一種構象時,不要求共價鍵的斷裂和重新形成。構象改變不會改變分子的光學活性。
3,肽單位(peptide unit):又稱為肽基(peptide group),是肽鍵主鏈上的重復結構。是由參於肽鏈形成的氮原子,碳原子和它們的4個取代成分:羰基氧原子,醯氨氫原子和兩個相鄰α-碳原子組成的一個平面單位。
4,蛋白質二級結構(protein在蛋白質分子中的局布區域內氨基酸殘基的有規則的排列。常見的有二級結構有α-螺旋和β-折疊。二級結構是通過骨架上的羰基和醯胺基團之間形成的氫鍵維持的。
5,蛋白質三級結構(protein tertiary structure): 蛋白質分子處於它的天然折疊狀態的三維構象。三級結構是在二級結構的基礎上進一步盤繞,折疊形成的。三級結構主要是靠氨基酸側鏈之間的疏水相互作用,氫鍵,范德華力和鹽鍵維持的。
6,蛋白質四級結構(protein quaternary structure):多亞基蛋白質的三維結構。實際上是具有三級結構多肽(亞基)以適當方式聚合所呈現的三維結構。
7,α-螺旋(α-heliv):蛋白質中常見的二級結構,肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結構,螺旋是靠鏈內氫鍵維持的。每個氨基酸殘基(第n個)的羰基與多肽鏈C端方向的第4個殘基(第4+n個)的醯胺氮形成氫鍵。在古典的右手α-螺旋結構中,螺距為0.54nm,每一圈含有3.6個氨基酸殘基,每個殘基沿著螺旋的長軸上升0.15nm.
8, β-折疊(β-sheet): 蛋白質中常見的二級結構,是由伸展的多肽鏈組成的。折疊片的構象是通過一個肽鍵的羰基氧和位於同一個肽鏈的另一個醯氨氫之間形成的氫鍵維持的。氫鍵幾乎都垂直伸展的肽鏈,這些肽鏈可以是平行排列(由N到C方向)或者是反平行排列(肽鏈反向排列)。
9,β-轉角(β-turn):也是多肽鏈中常見的二級結構,是連接蛋白質分子中的二級結構(α-螺旋和β-折疊),使肽鏈走向改變的一種非重復多肽區,一般含有2~16個氨基酸殘基。含有5個以上的氨基酸殘基的轉角又常稱為環(loop)。常見的轉角含有4個氨基酸殘基有兩種類型:轉角I的特點是:第一個氨基酸殘基羰基氧與第四個殘基的醯氨氮之間形成氫鍵;轉角Ⅱ的第三個殘基往往是甘氨酸。這兩種轉角中的第二個殘侉大都是脯氨酸。
10,超二級結構(super-secondary structure):也稱為基元(motif).在蛋白質中,特別是球蛋白中,經常可以看到由若干相鄰的二級結構單元組合在一起,彼此相互作用,形成有規則的,在空間上能辨認的二級結構組合體。
11,結構域(domain):在蛋白質的三級結構內的獨立折疊單元。結構域通常都是幾個超二級結構單元的組合。
12,纖維蛋白(fibrous protein):一類主要的不溶於水的蛋白質,通常都含有呈現相同二級結構的多肽鏈許多纖維蛋白結合緊密,並為 單個細胞或整個生物體提供機械強度,起著保護或結構上的作用。
13,球蛋白(globular protein):緊湊的,近似球形的,含有折疊緊密的多肽鏈的一類蛋白質,許多都溶於水。典形的球蛋白含有能特異的識別其它化合物的凹陷或裂隙部位。
14,角蛋白(keratin):由處於α-螺旋或β-折疊構象的平行的多肽鏈組成不溶於水的起著保護或結構作用蛋白質。
15,膠原(蛋白)(collagen):是動物結締組織最豐富的一種蛋白質,它是由原膠原蛋白分子組成。原膠原蛋白是一種具有右手超螺旋結構的蛋白。每個原膠原分子都是由3條特殊的左手螺旋(螺距0.95nm,每一圈含有3.3個殘基)的多肽鏈右手旋轉形成的。
16,疏水相互作用(hydrophobic interaction):非極性分子之間的一種弱的非共價的相互作用。這些非極性的分子在水相環境中具有避開水而相互聚集的傾向。
17,伴娘蛋白(chaperone):與一種新合成的多肽鏈形成復合物並協助它正確折疊成具有生物功能構向的蛋白質。伴娘蛋白可以防止不正確折疊中間體的形成和沒有組裝的蛋白亞基的不正確聚集,協助多肽鏈跨膜轉運以及大的多亞基蛋白質的組裝和解體。
18,二硫鍵(disulfide bond):通過兩個(半胱氨酸)巰基的氧化形成的共價鍵。二硫鍵在穩定某些蛋白的三維結構上起著重要的作用。
19,范德華力(van der Waals force):中性原子之間通過瞬間靜電相互作用產生的一弱的分子之間的力。當兩個原子之間的距離為它們范德華力半徑之和時,范德華力最強。強的范德華力的排斥作用可防止原子相互靠近。
20,蛋白質變性(denaturation):生物大分子的天然構象遭到破壞導致其生物活性喪失的現象。蛋白質在受到光照,熱,有機溶濟以及一些變性濟的作用時,次級鍵受到破壞,導致天然構象的破壞,使蛋白質的生物活性喪失。
21,肌紅蛋白(myoglobin):是由一條肽鏈和一個血紅素輔基組成的結合蛋白,是肌肉內儲存氧的蛋白質,它的氧飽和曲線為雙曲線型。
22,復性(renaturation):在一定的條件下,變性的生物大分子恢復成具有生物活性的天然構象的現象。
23,波爾效應(Bohr effect):CO2濃度的增加降低細胞內的pH,引起紅細胞內血紅蛋白氧親和力下降的現象。
24,血紅蛋白(hemoglobin): 是由含有血紅素輔基的4個亞基組成的結合蛋白。血紅蛋白負責將氧由肺運輸到外周組織,它的氧飽和曲線為S型。
25,別構效應(allosteric effect):又稱為變構效應,是寡聚蛋白與配基結合改變蛋白質的構象,導致蛋白質生物活性喪失的現象。
26,鐮刀型細胞貧血病(sickle-cell anemia): 血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的一種疾病,病人的大部分紅細胞呈鐮刀狀。其特點是病人的血紅蛋白β—亞基N端的第六個氨基酸殘缺是纈氨酸(vol),而不是下正常的谷氨酸殘基(Ghe)。
第三章
1,酶(enzyme):生物催化劑,除少數RNA外幾乎都是蛋白質。酶不改變反應的平衡,只是
通過降低活化能加快反應的速度。
2,脫脯基酶蛋白(apoenzyme):酶中除去催化活性可能需要的有機或無機輔助因子或輔基後的蛋白質部分。
3,全酶(holoenzyme):具有催化活性的酶,包括所有必需的亞基,輔基和其它輔助因子。
4,酶活力單位(U,active unit):酶活力單位的量度。1961年國際酶學會議規定:1個酶活力單位是指在特定條件(25oC,其它為最適條件)下,在1min內能轉化1μmol底物的酶量,或是轉化底物中1μmol的有關基團的酶量。
5,比活(specific activity):每分鍾每毫克酶蛋白在25oC下轉化的底物的微摩爾數。比活是酶純度的測量。
6,活化能(activation energy):將1mol反應底物中所有分子由其態轉化為過度態所需要的能量。
7,活性部位(active energy):酶中含有底物結合部位和參與催化底物轉化為產物的氨基酸殘基部分。活性部位通常位於蛋白質的結構域或亞基之間的裂隙或是蛋白質表面的凹陷部位,通常都是由在三維空間上靠得很進的一些氨基酸殘基組成。
8,酸-鹼催化(acid-base catalysis):質子轉移加速反應的催化作用。
9,共價催化(covalent catalysis):一個底物或底物的一部分與催化劑形成共價鍵,然後被轉移給第二個底物。許多酶催化的基團轉移反應都是通過共價方式進行的。
10,靠近效應(proximity effect):非酶促催化反應或酶促反應速度的增加是由於底物靠近活性部位,使得活性部位處反應劑有效濃度增大的結果,這將導致更頻繁地形成過度態。
11,初速度(initial velocity):酶促反應最初階段底物轉化為產物的速度,這一階段產物的濃度非常低,其逆反應可以忽略不計。
12,米氏方程(Michaelis-Mentent equation):表示一個酶促反應的起始速度(υ)與底物濃度([s])關系的速度方程:υ=υmax[s]/(Km+[s])
13,米氏常數(Michaelis constant):對於一個給定的反應,異至酶促反應的起始速度(υ0)達到最大反應速度(υmax)一半時的底物濃度。
14,催化常數(catalytic number)(Kcat):也稱為轉換數。是一個動力學常數,是在底物處於飽和狀態下一個酶(或一個酶活性部位)催化一個反應有多快的測量。催化常數等於最大反應速度除以總的酶濃度(υmax/[E]total)。或是每摩酶活性部位每秒鍾轉化為產物的底物的量(摩[爾])。
15,雙倒數作圖(double-reciprocal plot):那稱為Lineweaver_Burk作圖。一個酶促反應的速度的倒數(1/V)對底物度的倒數(1/LSF)的作圖。x和y軸上的截距分別代表米氏常數和最大反應速度的倒數。
16,競爭性抑製作用(competitive inhibition):通過增加底物濃度可以逆轉的一種酶抑制類型。競爭性抑制劑通常與正常的底物或配體競爭同一個蛋白質的結合部位。這種抑制使Km增大而
υmax不變。
17,非競爭性抑製作用(noncompetitive inhibition): 抑制劑不僅與游離酶結合,也可以與酶-底物復合物結合的一種酶促反應抑製作用。這種抑制使Km不變而υmax變小。
18,反競爭性抑製作用(uncompetitive inhibition): 抑制劑只與酶-底物復合物結合而不與游離的酶結合的一種酶促反應抑製作用。這種抑制使Km和υmax都變小但υmax/Km不變。
19,絲氨酸蛋白酶(serine protease): 活性部位含有在催化期間起親核作用的絲氨殘基的蛋白質。
20,酶原(zymogen):通過有限蛋白水解,能夠由無活性變成具有催化活性的酶前體。
21,調節酶(regulatory enzyme):位於一個或多個代謝途徑內的一個關鍵部位的酶,它的活性根據代謝的需要而增加或降低。
22,別構酶(allosteric enzyme):活性受結合在活性部位以外的部位的其它分子調節的酶。
23,別構調節劑(allosteric molator):結合在別構調節酶的調節部位調節該酶催化活性的生物分子,別構調節劑可以是激活劑,也可以是抑制劑。
24,齊變模式(concerted model):相同配體與寡聚蛋白協同結合的一種模式,按照最簡單的齊變模式,由於一個底物或別構調節劑的結合,蛋白質的構相在T(對底物親和性低的構象)和R(對底物親和性高的構象)之間變換。這一模式提出所有蛋白質的亞基都具有相同的構象,或是T構象,或是R構象。
25,序變模式(sequential model):相同配體與寡聚蛋白協同結合的另外一種模式。按照最簡單的序變模式,一個配體的結合會誘導它結合的亞基的三級結構的變化,並使相鄰亞基的構象發生很大的變化。按照序變模式,只有一個亞基對配體具有高的親和力。
26,同功酶(isoenzyme isozyme):催化同一化學反應而化學組成不同的一組酶。它們彼此在氨基酸序列,底物的親和性等方面都存在著差異。
27,別構調節酶(allosteric molator):那稱為別構效應物。結合在別構酶的調節部位,調節酶催化活性的生物分子。別構調節物可以是是激活劑,也可以是抑制劑。
第四章
1,維生素(vitamin):是一類動物本身不能合成,但對動物生長和健康又是必需的有機物,所以必需從食物中獲得。許多輔酶都是由維生素衍生的。
2,水溶性維生素(water-soluble vitamin):一類能溶於水的有機營養分子。其中包括在酶的催化中起著重要作用的B族維生素以及抗壞血酸(維生素C)等。
3,脂溶性維生素(lipid vitamin):由長的碳氫鏈或稠環組成的聚戊二烯化合物。脂溶性維生素包括A,D,E,和K,這類維生素能被動物貯存。
4,輔酶(conzyme):某些酶在發揮催化作用時所需的一類輔助因子,其成分中往往含有維生素。輔酶與酶結合鬆散,可以通過透析除去。
5,輔基(prosthetic group):是與酶蛋白質共價結合的金屬離子或一類有機化合物,用透析法不能除去。輔基在整個酶促反應過程中始終與酶的特定部位結合。
6,尼克醯胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)和尼克醯胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP+):含有尼克醯胺的輔酶,在某些氧化還原中起著氫原子和電子載體的作用,常常作為脫氫酶的輔。
7,黃素單核苷酸(FMN)一種核黃素磷酸,是某些氧化還原反應的輔酶。
8,硫胺素焦磷酸(thiamine phosphate):是維生素B1的輔形式,參與轉醛基反應。
9,黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD):是某些氧化還原反應的輔酶,含有核黃素。
10,磷酸吡哆醛(pyidoxal phosphate):是維生素B6(吡哆醇)的衍生物,是轉氨酶,脫羧酶和消旋酶的酶。
11,生物素(biotin):參與脫羧反應的一種酶的輔助因子。
12,輔酶A(coenzyme A):一種含有泛酸的輔酶,在某些酶促反應中作為醯基的載體。
13,類胡蘿卜素(carotenoid):由異戊二烯組成的脂溶性光合色素。
14,轉氨酶(transaminase):那稱為氨基轉移酶,在該酶的催化下,一個α-氨基酸的氨基可轉移給別一個α-酮酸。
第五章
1,醛糖(aldose):一類單糖,該單糖中氧化數最高的C原子(指定為C-1)是一個醛基。
2,酮糖(ketose):一類單糖,該單糖中氧化數最高的C原子(指定為C-2)是一個酮基。
3,異頭物(anomer):僅在氧化數最高的C原子(異頭碳)上具有不同構形的糖分子的兩種異構體。
4,異頭碳(anomer carbon):環化單糖的氧化數最高的C原子,異頭碳具有羰基的化學反應性。
5,變旋(mutarotation):吡喃糖,呋喃糖或糖苷伴隨它們的α-和β-異構形式的平衡而發生的比旋度變化。
6,單糖(monosaccharide):由3個或更多碳原子組成的具有經驗公式(CH2O)n的簡糖。
7,糖苷(dlycoside):單糖半縮醛羥基與別一個分子的羥基,胺基或巰基縮合形成的含糖衍生物。
8,糖苷鍵(glycosidic bond):一個糖半縮醛羥基與另一個分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羥基、胺基或巰基之間縮合形成的縮醛或縮酮鍵,常見的糖醛鍵有O—糖苷鍵和N—糖苷鍵。
9,寡糖(oligoccharide):由2~20個單糖殘基通過糖苷鍵連接形成的聚合物。
10,多糖(polysaccharide):20個以上的單糖通過糖苷鍵連接形成的聚合物。多糖鏈可以是線形的或帶有分支的。
11,還原糖(recing sugar):羰基碳(異頭碳)沒有參與形成糖苷鍵,因此可被氧化充當還原劑的糖。
12,澱粉(starch):一類多糖,是葡萄糖殘基的同聚物。有兩種形式的澱粉:一種是直鏈澱粉,是沒有分支的,只是通過α-(1→4)糖苷鍵的葡萄糖殘基的聚合物;另一類是支鏈澱粉,是含有分支的,α-(1→4)糖苷鍵連接的葡萄糖殘基的聚合物,支鏈在分支處通過α-(1→6)糖苷鍵與主鏈相連。
13,糖原(glycogen): 是含有分支的α-(1→4)糖苷鍵的葡萄糖殘基的同聚物,支鏈在分支點處通過α-(1→6)糖苷鍵與主鏈相連。
14,極限糊精(limit dexitrin):是指支鏈澱粉中帶有支鏈的核心部位,該部分經支鏈澱粉酶水解作用,糖原磷酸化酶或澱粉磷酸化酶作用後仍然存在。糊精的進一步降解需要α-(1→6)糖苷鍵的水解。
15,肽聚糖(peptidoglycan):N-乙醯葡萄糖胺和N-乙醯唾液酸交替連接的雜多糖與不同的肽交叉連接形成的大分子。肽聚糖是許多細菌細胞壁的主要成分。
16,糖蛋白(glycoprotein):含有共價連接的葡萄糖殘基的蛋白質。
17,蛋白聚糖(proteoglycan):由雜多糖與一個多肽連組成的雜化的在分子,多糖是分子的主要成分。
第六章
1,脂肪酸(fatty acid):是指一端含有一個羧基的長的脂肪族碳氫鏈。脂肪酸是最簡單的一種脂,它是許多更復雜的脂的成分。
2,飽和脂肪酸(saturated fatty acid):不含有—C=C—雙鍵的脂肪酸。
3,不飽和脂肪酸(unsaturated fatty acid):至少含有—C=C—雙鍵的脂肪酸。
4,必需脂肪酸(occential fatty acid):維持哺乳動物正常生長所必需的,而動物又不能合成的脂肪酸,Eg亞油酸,亞麻酸。
5,三脂醯苷油(triacylglycerol):那稱為甘油三酯。一種含有與甘油脂化的三個脂醯基的酯。脂肪和油是三脂醯甘油的混合物。
6,磷脂(phospholipid):含有磷酸成分的脂。Eg卵磷脂,腦磷脂。
7,鞘脂(sphingolipid):一類含有鞘氨醇骨架的兩性脂,一端連接著一個長連的脂肪酸,另一端為一個極性和醇。鞘脂包括鞘磷脂,腦磷脂以及神經節苷脂,一般存在於植物和動物細胞膜內,尤其是在中樞神經系統的組織內含量豐富。
8,鞘磷脂(sphingomyelin):一種由神經醯胺的C-1羥基上連接了磷酸毛里求膽鹼(或磷酸乙醯胺)構成的鞘脂。鞘磷脂存在於在多數哺乳動物動物細胞的質膜內,是髓鞘的主要成分。
9,卵磷脂(lecithin):即磷脂醯膽鹼(PC),是磷脂醯與膽鹼形成的復合物。
10,腦磷脂(cephalin):即磷脂醯乙醇胺(PE),是磷脂醯與乙醇胺形成的復合物。
11,脂質體(liposome):是由包圍水相空間的磷脂雙層形成的囊泡(小泡)。
12,生物膜(bioligical membrane):鑲嵌有蛋白質的脂雙層,起著畫分和分隔細胞和細胞器作用生物膜也是與許多能量轉化和細胞內通訊有關的重要部位。
13,內在膜蛋白(integral membrane protein):插入脂雙層的疏水核和完全跨越脂雙層的膜蛋白。
14,外周膜蛋白(peripheral membrane protein):通過與膜脂的極性頭部或內在的膜蛋白的離子相互作用和形成氫鍵與膜的內或外表面弱結合的膜蛋白。
15,流體鑲嵌模型(fluid mosaic model):針對生物膜的結構提出的一種模型。在這個模型中,生物膜被描述成鑲嵌有蛋白質的流體脂雙層,脂雙層在結構和功能上都表現出不對稱性。有的蛋白質「鑲「在脂雙層表面,有的則部分或全部嵌入其內部,有的則橫跨整個膜。另外脂和膜蛋白可以進行橫向擴散。
16,通透系數(permeability coefficient):是離子或小分子擴散過脂雙層膜能力的一種量度。通透系數大小與這些離子或分子在非極性溶液中的溶解度成比例。
17,通道蛋白(channel protein):是帶有中央水相通道的內在膜蛋白,它可以使大小適合的離子或分子從膜的任一方向穿過膜。
18,(膜)孔蛋白(pore protein):其含意與膜通道蛋白類似,只是該術語常用於細菌。
19,被動轉運(passive transport):那稱為易化擴散。是一種轉運方式,通過該方式溶質特異的結合於一個轉運蛋白上,然後被轉運過膜,但轉運是沿著濃度梯度下降方向進行的,所以被動轉達不需要能量的支持。
20,主動轉運(active transport):一種轉運方式,通過該方式溶質特異的結合於一個轉運蛋白上然後被轉運過膜,與被動轉運運輸方式相反,主動轉運是逆著濃度梯度下降方向進行的,所以主動轉運需要能量的驅動。在原發主動轉運過程中能源可以是光,ATP或電子傳遞;而第二級主動轉運是在離子濃度梯度下進行的。
21,協同運輸(contransport):兩種不同溶質的跨膜的耦聯轉運。可以通過一個轉運蛋白進行同一方向(同向轉運)或反方向(反向轉運)轉運。
22,胞吞(信用)(endocytosis):物質被質膜吞入並以膜衍生出的脂囊泡形成(物質在囊泡內)被帶入到細胞內的過程。
第七章
1,核苷(nucleoside):是嘌呤或嘧啶鹼通過共價鍵與戊糖連接組成的化合物。核糖與鹼基一般都是由糖的異頭碳與嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之間形成的β-N-糖鍵連接。
2,核苷酸(uncleoside):核苷的戊糖成分中的羥基磷酸化形成的化合物。
3,cAMP(cycle AMP):3ˊ,5ˊ-環腺苷酸,是細胞內的第二信使,由於某部些激素或其它分子信號刺激激活腺苷酸環化酶催化ATP環化形成的。
4,磷酸二脂鍵(phosphodiester linkage):一種化學基團,指一分子磷酸與兩個醇(羥基)酯化形成的兩個酯鍵。該酯鍵成了兩個醇之間的橋梁。例如一個核苷的3ˊ羥基與別一個核苷的5ˊ羥基與同一分子磷酸酯化,就形成了一個磷酸二脂鍵。
5,脫氧核糖核酸(DNA):含有特殊脫氧核糖核苷酸序列的聚脫氧核苷酸,脫氧核苷酸之間是是通過3ˊ,5ˊ-磷酸二脂鍵連接的。DNA是遺傳信息的載體。
6,核糖核酸(RNA):通過3ˊ,5ˊ-磷酸二脂鍵連接形成的特殊核糖核苷酸序列的聚核糖核苷酸。
7,核糖體核糖核酸(Rrna,ribonucleic acid):作為組成成分的一類 RNA,rRNA是細胞內最 豐富的 RNA .
8,信使核糖核酸(mRNA,messenger ribonucleic acid):一類用作蛋白質合成模板的RNA .
9, 轉移核糖核酸(Trna,transfer ribonucleic acid):一類攜帶激活氨基酸,將它帶到蛋白質合成部位並將氨基酸整合到生長著的肽鏈上RNA。TRNA含有能識別模板mRNA上互補密碼的反密碼。
10,轉化(作用)(transformation):一個外源DNA 通過某種途徑導入一個宿主菌,引起該菌的遺傳特性改變的作用。
11,轉導(作用)(transction):藉助於病毒載體,遺傳信息從一個細胞轉移到另一個細胞。
12,鹼基對(base pair):通過鹼基之間氫鍵配對的核酸鏈中的兩個核苷酸,例如A與T或U , 以及G與C配對 。
13,夏格夫法則(Chargaff』s rules):所有DNA中腺嘌呤與胸腺嘧啶的摩爾含量相等(A=T),鳥嘌呤和胞嘧啶的摩爾含量相等(G=C),既嘌呤的總含量相等(A+G=T+C)。DNA的鹼基組成具有種的特異性,但沒有組織和器官的特異性。另外,生長和發育階段`營養狀態和環境的改變都不影響DNA的鹼基組成。
14,DNA的雙螺旋(DNAdouble helix):一種核酸的構象,在該構象中,兩條反向平行的多核甘酸鏈相互纏繞形成一個右手的雙螺旋結構。鹼基位於雙螺旋內側,磷酸與糖基在外側,通過磷酸二脂鍵相連,形成核酸的骨架。鹼基平面與假象的中心軸垂直,糖環平面則與軸平行,兩條鏈皆為右手螺旋。雙螺旋的直徑為2nm,鹼基堆積距離為0.34nm, 兩核甘酸之間的夾角是36゜,每對螺旋由10對鹼基組成,鹼基按A-T,G-C配對互補,彼此以氫鍵相聯系。維持DNA雙螺旋結構的穩定的力主要是鹼基堆積力。雙螺旋表面有兩條寬窄`深淺不一的一個大溝和一個小溝。
15.大溝(major groove)和小溝(minor groove):繞B-DNA雙螺旋表面上出現的螺旋槽(溝),寬的溝稱為大溝,窄溝稱為小溝。大溝,小溝都、是由於鹼基對堆積和糖-磷酸骨架扭轉造成的。

❷ 托福閱讀背景知識:地球最早是怎麼產生生物

托福真題再現:
版本一
1,地球早起大氣成分及生物 早起甲烷與二氧化碳佔主要地位,沒有氧氣。因為有了會光合作用的細菌,產生了大量氧氣,消耗二氧化碳,提供臭氧層,為當今新生物鍾提供必要環境。
版本二
有一個講地球最早怎麼產生生物的
大概有幾點,首先是太陽當時不夠熱,地球當時氣體組成像火山的,主要靠兩種氣體加溫度,似乎一種是二氧化碳另一種是m開頭的不認識
那種氣體組成不適合生命也沒什麼氧,當時的organism有很大作用,進行光合作用產生氧氣吸收二氧化碳,二氧化碳還有一部分被轉移成非氣態的,這樣就形成了後來的大氣組成
氧氣可以形成臭氧層,保護生物不受紫外線輻射,這塊提到了火星等其他星球就沒有臭氧層或者臭氧不夠多blabla不記得了,反正當時生物都去海里了因為水可以吸收紫外線輻射保護它們
威學一百解析:本文屬於生命起源類型,是托福閱讀資歷很老的話題之一,寫作角度涉及到巴斯德實驗、生命起源的幾種假說,以及過程的描述,同學在閱讀中的難點是要克服對生僻詞彙和背景知識的恐懼心理,這些都可以通過多讀和精讀來實現。

參考閱讀:
There is no truly "standard" model of the origin of life. But most currently accepted modelsbuild in one way or another upon a number of discoveries about the origin of molecular andcellular components for life, which are listed in a rough order of postulated emergence:
1. Plausible pre-biotic conditions result in the creation of certain basic small molecules(monomers) of life, such as amino acids. This was demonstrated in the Miller-Urey experimentby Stanley L. Miller and Harold C. Urey in 1953, although it is now generally held that theirlaboratory conditions did not reflect the original Earth's atmosphere.
2. Phospholipids (of an appropriate length) can spontaneously form lipid bilayers, a basiccomponent of the cell membrane.
3. The polymerization of nucleotides into random RNA molecules might have resulted inself-replicating ribozymes (RNA world hypothesis).
4. Selection pressures for catalytic efficiency and diversity result in ribozymes, whichcatalyse peptidyl transfer (hence formation of small proteins), since oligopeptides complexwith RNA to form better catalysts. Thus the first ribosome is born, and protein synthesisbecomes more prevalent.
5. Protein out-compete ribozymes in catalytic ability, and therefore become the dominantbiopolymer. Nucleic acids are restricted to predominantly genomic use.
There are many different hypotheses regarding the path that might have been taken fromsimple organic molecules to protocells and metabolism. Many models fall into the "genes-first"category or the "metabolism-first" category, but a recent trend is the emergence of hybridmodels.
The origin of the basic biomolecules, while not settled, is less controversial than thesignificance and order of steps 2 and 3. The basic chemicals from which life was thought to haveformed are commonly held to be methane (CH4), ammonia (NH3), water (H2O), hydrogensulfide (H2S), carbon dioxide (CO2) or carbon monoxide (CO), and phosphate (PO43-).Molecular oxygen (O2) and ozone (O3) typically are considered to have been either rare orabsent.
As of 2007, no one had yet synthesized a "protocell" using basic components that wouldhave the necessary properties of life (the so-called "bottom-up-approach"). Without such aproof-of-principle, explanations have tended to be short on specifics. However, someresearchers working in this field have argued that a "top-down approach" is more feasible.One such approach involves engineering existing prokaryotic cells with progressively fewergenes, attempting to discern at which point the most minimal requirements for life werereached. The biologist John Desmond Bernal coined the term biopoesis for this process, andsuggested that there were a number of clearly defined "stages" that could be recognized inexplaining the origin of life.
Stage 1: The origin of biological monomers
Stage 2: The origin of biological polymers
Stage 3: The evolution from molecules to cell
Bernal suggested that Darwinian evolution may have commenced early, some time betweenStage 1 and 2.

❸ phenotypically plastic什麼意思生態學方面的詞彙

表型可塑

❹ muc1粘蛋白的MUC1的分子生物學和生物化學

MUC1又名PEM(polymorphic epithelial mucin), PUM(peanut lectin binding urinary mucins), DF3, MAM-6, CA 15-3等, 其不同的命名是由於對其分離和檢測的方法等的不同而來, 其cDNA克隆是通過篩選從乳腺癌、胰腺癌等細胞系構建的cDNA表達文庫而得到的。人MUC1基因定位於染色體1q21, 含有7個外顯子。MUC1基因的一個重要特徵是其多態性(polymorphism), 即其第2個外顯子中含有許多連續重復序列(variable number of tandem repeats, VNTRs),每個VNTR含有60個鹼基, 富含GC, 不同人的VNTRs數量從20~125不等,最常見的2個等位基因分別含有41和85個VNTRs, 同一個體的不同等位基因其VNTRs的數量也可能不同, 而小鼠的MUC1基因無此多態性。MUC1的這一特徵表明它是一種典型的小衛星序列(minisatellite sequence)。近期研究結果推測, 小衛星重復單位數量的變化主要是由種系復合基因轉變事件造成的。
不同種屬的MUC1基因的差別主要表現在VNTRs的組成不同,但某些區域的組成卻是保守的, 如人和小鼠(MUC1)基因的比較研究表明, 轉錄起始位點上游500 bp內的轉錄起始區, 特別是TATA盒上游區域結構是高度保守的, 這可能與MUC1在上皮性細胞中的特異性表達有關。 MUC1基因的編碼產物MUC1粘蛋白是一種高分子量糖蛋白(>200 kD), 其基本特徵:① 糖鏈占整個粘蛋白含量的50%以上, 且多以O-糖苷鍵與多肽骨架上的Ser/Thr相連; ② 多肽骨架中含有PTS區, 即富含Pro(P),Thr(T)和Ser(S)3種氨基酸的區域, 這3種氨基酸占整個肽鏈氨基酸含量的20%~55%,此區內含有許多連續重復肽鏈序列, 所有的O-糖基化位點均位於這些序列中。
MUC1的多肽骨架由胞外段、跨膜段和胞內段3部分組成, 跨膜段和胞內段(含72個氨基酸),在不同種間其結構是高度保守的, 表明它們在MUC1的功能發揮上可能起重要作用; 胞外段含有20~125個連續重復序列, 每個重復序列含有20個氨基酸, 即PDTRPAPGSTAPPAHGVTSA, 其中S,T,A,G,P 5種氨基酸佔50%以上, P對MUC1空間結構的形成從而對其免疫原性的決定起重要作用。不同個體間連續重復序列數量的不同是由MUC1基因的多態性所決定的, 因此,胞外段長短可從400~2 500氨基酸不等, 每個連續重復序列中含有5個潛在的O-糖基化位點, 其中的4個可發生O-糖基化反應, S,T相鄰是糖基化的必要條件。
糖鏈多以O型糖苷鍵與多肽骨架連接。每條糖鏈含有1~20個單糖,以GalNAc(15.0%), GluNAc (19.8%), Gal(44.9%),Fuc(8.9%)和SA(11.4%)最為常見,由核心區、骨架區和外周區組成。核心區是指與多肽骨架上的Ser/Thr相連的GalNAc及直接與GalNAc相連的糖鏈部分; 骨架區分為Ⅰ型(Galα-3GlcNAc)和Ⅱ型(Galα-4GlcNAc1-3)2種, Ⅰ型結構一般單個存在, 而Ⅱ型可多個同時存在; 外周區是指骨架區末端以α-糖苷鍵連接的Gal, GalNAc, Fuc, SA及硫酸基, 這些基團在決定MUC1的生化特性(如電荷等)和功能方面起重要作用。末端糖基的加入對糖鏈的延伸起終止作用, 同時也產生了某些糖鏈表位, 如血型抗原A, B和H, Lea和Leb, X, Y及Cd抗原決定簇。由於含28個氨基酸的肽鏈O-糖基化後長度為7 nm, 因此, MUC1胞外段的長度約為240~630 nm, 是細胞表面最先與機體免疫系統接觸的膜表面分子之一。 研究表明,MUC1基因的表達主要在轉錄水平進行調控。這種調控作用是通過MUC1啟動子上的順式作用元件和細胞中的轉錄因子間的相互作用來實現的。MUC1的啟動子序列約2.9 kb,其中,發揮調控作用的順式作用元件主要位於5′開放區743 bp的序列范圍內。MUC1啟動子含有2個Sp1結合位點(GGGGC GGGG),分別位於-576/-568和-99/-90,另外,-101/
-89處有1個SpA結合位點(AGGGGCGGGGTT),-84/-64有1個E-box(E-MUC1)。Sp1與其結合位點的相互作用可促進MUC1基因的表達,而SpA則下調其表達。Sp1和SpA的比例可能是決定MUC1基因表達水平的一個重要因素。腫瘤細胞MUC1的高水平表達,可能與二者之間的調控失調有關。Sp1位點與E-box(E-MUC1)可能與MUC1的組織特異性表達有關。最新分析表明,MUC1啟動子中含有乳腺特異性、造血細胞特異性、B細胞特異性、T細胞特異性、肝細胞特異性、肌細胞特異性順式作用元件,這與最近報道的MUC1在除上皮組織外的多種組織和細胞中表達是一致的,MUC1啟動子含有多樣性的順式作用元件,是目前已知真核啟動子中比較獨特的一種。對其結構及其與轉錄因子間相互作用的研究,對於闡明MUC1基因在腫瘤發生、發展中的作用並為腫瘤治療提供新的線索具有重要意義。
對於MUC1基因轉錄後的選擇性剪切而形成不同同種型的機制,目前還不清楚。由於MUC1/Y具有腫瘤特異性表達的特點,因此,這種選擇性剪切可能與細胞的癌變有一定的關系。 目前的研究表明,MUC1即可誘發抗鬃瘤的CTL免疫應答(MHC限制性和非MHC限制性),同時又可抑制免疫活性細胞對腫瘤的殺傷作用,高水平的MUC1表達與腫瘤患者的預後呈負相關,提示MUC1可能參與免疫應答的調節。
Finn的研究小組首先發現在乳腺癌、卵巢癌、胰腺癌患者體內存在可殺傷腫瘤細胞的CTL,其特點為非MHC限制性。隨後他們又在乳腺癌患者中發現了具有MHCⅠ限制性的識別MUC1表位的CTL。這些現象也在小鼠體內得到了進一步的驗證。正是上述發現使MUC1成為一種腫瘤生物治療的靶分子。 如上所述, MUC1在癌變時可發生量和質的改變, 出現新的抗原表位, 同時, 由於MUC1是最先與機體免疫系統接觸的細胞表面分子之一,腫瘤MUC1可以非MHC限制性和MHC限制性方式活化CTLs,這些活化的CTLs可殺傷表達MUC1的腫瘤細胞。因此, MUC1是腫瘤主動特異性免疫治療(active specific immunotherapy)理想的靶分子。
目前, 有多種基於MUC1的免疫原作為疫苗用於腫瘤治療的研究, 有些已經進入臨床實驗階段。 自MUC1發現以來,已有多家研究機構制備了多種MUC1單克隆抗體,其中56株已得到國際腫瘤生物醫學協會(ISOBM)的確認(見表1),這些抗體中的大多
表1ISOBM確認的MUC1單克隆抗體
ISOBM編號 單抗名稱 研製單位 研究者 同種型
ISOBM-122 Ma 552 CanAg Nilsson, O. IgG1
ISOBM-123 BC3 Austin Research Institute McKenzie I. IgM
ISOBM-124 HMPV Austin Research Institute McKenzie I. IgM
ISOBM-125 VU- 3-C6 Univ. Hosp. 「Vrije Universiteit」 Hilgers, J. IgG1
ISOBM-126 VU-12-E1 Univ. Hosp. 「Vrije Universiteit」 Hilgers, J. IgG1
ISOBM-127 SH1 University of Copenhagen Clausen, H. IgG3-k
ISOBM-128 DH-1 Austin Research Institute McKenzie I. IgM
ISOBM-129 MF06 C.I.S. Biointernational Seguin, P. IgG1
ISOBM-130 VU-11-D1 Univ. Hosp. 「Vrije Universiteit」 Hilgers, J. IgG1
ISOBM-131 VA1 Austin Research Institute McKenzie I. IgG1
ISOBM-132 MF30 C.I.S. Biointernational Seguin, P. IgG1
ISOBM-133 BCP 8 Austin Research Institute McKenzie I. IgG2b
ISOBM-134 BW 835 Behringwerke AG Schelp, C. IgG1
ISOBM-135 SMA-1 Austin Research Institute McKenzie I. IgM
ISOBM-136 DF3 Centocor Cornillie, F. IgG1
ISOBM-137 27.1 Austin Research Institute McKenzie I. IgG1
ISOBM-138 BC2 Austin Research Institute McKenzie I. IgG1
ISOBM-139 B27.29 Biomira Inc. Craig, D. IgG1
ISOBM-140 VU- 3-D1 Univ. Hosp. 「Vrije Universiteit」 Hilgers, J. IgG1
ISOBM-141 BCP 7 Austin Research Institute McKenzie I. IgG2a
ISOBM-142 7540MR Bayer Yeung, K. IgG1
ISOBM-143 M26 Sanofi IgM+G1-k
ISOBM-144 VU- 4-H5 Univ. Hosp. 「Vrije Universiteit」 Hilgers, J. IgG1
ISOBM-145 3E1.2 Austin Research Institute McKenzie I. IgM
ISOBM-146 232A1 Netherlands Cancer Institute Hilkens, J. IgG1
ISOBM-147 BCP 9 Austin Research Institute McKenzie I. IgG1
ISOBM-148 115 D8 Centocor Cornillie, F. IgG2b-k
ISOBM-149 MF11 C.I.S. Biointernational Seguin, P. IgG1
ISOBM-150 KC4 Immunotech SA Agthoven, A. Van IgG3
ISOBM-151 5F4 University of Copenhagen Clausen, H. IgM
ISOBM-152 M29 Sanofi IgG1-k
ISOBM-153 BC4E549 Hybritech Inc. Rittenhouse, H. IgG1-k
ISOBM-154 Ma 695 CanAg Nilsson, O. IgG1
ISOBM-155 Sec1 Austin Research Institute McKenzie I. IgG2b
ISOBM-156 VU-11-E2 Univ. Hosp. 「Vrije Universiteit」 Hilgers, J. IgG1
ISOBM-157 HH 6 University of Copenhagen Clausen, H. IgG3-k
ISOBM-158 M38 Sanofi IgG1-k
ISOBM-159 E29 Dako A/S Askaa, J. IgG2a
ISOBM-160 HH14 University of Copenhagen Clausen, H. IgM
ISOBM-161 GP1.4 Immunotech SA Agthoven, A. van IgG1
ISOBM-162 214D4 Netherlands Cancer Institute Hilkens, J. IgG1
ISOBM-163 43 Austin Research Institute McKenzie I. IgM
ISOBM-164 CC2 Austin Research Institute McKenzie I. IgM
ISOBM-165 SM3 Imperial Cancer Research Fund Burchell, J. IgG1
ISOBM-166 12C10 Transgene SA Acres, B. IgG1-k
ISOBM-167 FH6 University of Copenhagen Clausen, H. IgM
ISOBM-168 BC5N154 Hybritech Inc. Rittenhouse, H. IgM
ISOBM-169 HMFG-1 Imperial Cancer Research Fund Burchell, J. IgG1
ISOBM-170 VA2 Austin Research Institute McKenzie I. IgG1
ISOBM-171 B12 Roche Diagnostic Systems Pfleiderer, P. IgG1
ISOBM-172 C595 University of Nothingham Price, M. IgG3
ISOBM-173 BCRU-G7 Norwegian Radium Hospital Rye, P. IgM
ISOBM-174 BCP10 Austin Research Institute McKenzie I. IgM
ISOBM-175 MC5 Immunotech SA Agthoven, A. van IgG1-k
ISOBM-176 7539MR Bayer Yeung, K. IgG2b
ISOBM-177 A76-A/C7 Max Delbrueck Centre f. Mol.Med. Karsten, U. IgG1+M-k
數的識別表位位於MUC1 VNTRs中的APDTRPAPG區域,如BC2識別APDTR,HMFG1識別PDTR等。由於MUC1在腫瘤細胞表面的高度異常表達,使其成為一種潛在的腫瘤靶向治療的靶分子。目前已有多個實驗室在利用MUC1單抗進行腫瘤治療的研究。

❺ wxb是哪家公司的數字貨幣

英為財情的數字貨幣行情庫已經涵蓋超過2500種虛擬幣,搜索bstc,無結果,說明並不存在這樣一種流行的數字貨幣。
不過,美股市場中,有一支股票的股票代碼是bstc,即biospecifics生物
(bstc)

❻ 什麼叫生物多樣性

提到生物多樣性,大多數人頭腦中可能只是個關於動植物種類的簡單概念。然而,在巴黎召開的生物多樣性國際會議上,不少專家指出,這是人們對生物多樣性概念的許多誤解之一。
生物多樣性概念是20世紀80年代首次被提出的。1992年裡約地球峰會正式推廣了這一概念,它指所有地球上的生物以及它們呈現的不同遺傳特性和多樣化的生態系統。在現存1000萬到3000萬物種中,有約130萬到150萬面臨生存威脅。如今,各類生態系統遭到的破壞及其對環境變化適應力的減退,比以往估計的更為嚴重。

地球上生存著多種多樣的生物,每一個種群都有自己的基因庫,不同的種群有不同的基因庫,這就是基因的多樣性,即遺傳的多樣性。遺傳的多樣性構成了物種的多樣性、物種的多樣性構成了生態系統的多樣性。因為基因是物種的組成部分,物種是生態系統的組成部分。因此,遺傳的多樣性、物種的多樣性和生態系統的多樣性,是從微觀到宏觀,在三個不同水平上來研究和分析生物多樣性的基本特點。其中基因是生物多樣性概念的基礎,物種是生物多樣性概念的中心,生態系統是生物多樣性概念關鍵環節。
生物多樣性是包括地球上所有植物、動物、微生物和它們擁有的基因以及由這些生物和環境構成的生態系統;是生物進化留下來的寶貴財富;是人類社會賴以生存和發展的基礎。保護生物多樣性就是在基因、物種和生態系統三個水平上採取保護戰略和保護措施。

生物多樣性的價值。
野生生物是與人工馴養、種植的動植物相比較而言,泛指那些在野外生活的植物、動物和微生物,它們所擁有的全部基因以及各種各樣的生態系統。因此,野生生物資源是組成生物多樣性的一個重要方面。野生生物資源具有直接使用價值、間接使用價值和潛在使用價值,是人類賴以生存的重要物質基礎。只有全面認識野生生物資源的價值所在,才能增強並樹立保護野生生物資源的意識、規范人們的行為方式,採取具體措施保護野生生物資源並加以合理利用,使野生生物資源世世代代地、可持續地為人類造福。
1.直接使用價值
野生生物的直接使用價值包括:①葯用價值:如青蒿素是一種野生植物中的一種生物鹼,是治療瘧疾的特效葯物;②重要的工業原料:如從一種叫霍霍巴的灌木中提煉出油脂可替代鯨的油脂作為高級潤滑油的原料;③科學研究價值:如一種寄生於葡萄根部的蚜蟲從北美傳到歐洲、使所有葡萄園幾乎都遭到毀滅,後來人們發現美國的一種野生葡萄能夠抵抗這種蚜蟲,科學家利用這一特性,把歐洲葡萄嫁接到美洲葡萄砧木上,才使歐洲葡萄逃脫了毀滅的厄運;又如雜交水稻之父袁隆平利用野生雄性不育稻和栽培稻雜交,培育出雜交水稻「野敗」,在解決世界糧食短缺問題方面引起了全球的關注。總之,野生生物是培育生物新品種不可缺少的基因庫;④美學價值:如「花園城市」的建設離不開色彩紛呈的各種植物,名山大川與五顏六色的花鳥魚蟲相配合,才構成令人賞心悅目、流連忘返的美景;⑤文學創作的素材:如我國古代文學和現代文學作品中,有許多描寫植物或借植物抒發情懷的詩句或作品。蘇軾的「竹外桃花三兩枝,春江水暖鴨先知」,將早春的暖意和生機描寫得細致入微。茅盾的《白楊禮贊》、陶鑄的《松樹的風格》、朱自清的《荷塘月色》,都借植物抒發高潔的情懷,產生了廣泛的影響。因此,生物多樣性能激發人們文學藝術創作的靈感。
2.間接使用價值
間接使用價值是指生物多樣性具有重要的生態功能。任何一個生態系統都是由生物群落和無機環境構成的,野生生物則是構成生物群落中生產者、消費者和分解者的重要成分。在生態系統中,野生生物之間具有相互依存和相互制約的關系,共同維系著生態系統的結構和功能,維持生態系統的穩定性。如果野生生物資源受到破壞,勢必影響生態系統的穩定性,進而影響人類的生存與發展。
3.潛在使用價值
潛在使用價值是指目前人們還不清楚的但肯定具有的巨大的使用價值。一種野生生物一旦從地球上消失,就無法再生,它的各種潛在的使用價值也就不復存在了。

❼ microRNA sensors: microRNAsB表達位置哪位知道誰能說幾個好點的生物方面的論壇啊

MicroRNA(miRNA)是一類內生的、長度約20-24個核苷酸的小RNA,是發夾結構的約70-90個鹼基大小的單鏈RNA前體經過Dicer酶加工後生成。其在細胞內具有多種重要的調節作用。每個miRNA可以有多個靶基因,而幾個miRNAs也可以調節同一個基因。這種復雜的調節網路既可以通過一個miRNA來調控多個基因的表達,也可以通過幾個miRNAs的組合來精細調控某個基因的表達。隨著miRNA調控基因表達的研究的逐步深入,將幫助我們理解高等真核生物的基因組的復雜性和復雜的基因表達調控網路。miRNA廣泛存在於真核生物中,是一組不編碼蛋白質的短序列RNA,其本身不具有開放閱讀框(ORF)。成熟的miRNA,5′端有一個磷酸基團,3′端為羥基。編碼miRNAs的基因最初產生一個長的pri-RNA分子,這種初期分子還必須被剪切成約70-90個鹼基大小、具發夾結構單鏈RNA前體(pre-miRNA)並經過Dicer酶加工後生成。成熟的miRNA 5』端的磷酸基團和3端羥基則是它與相同長度的功能RNA降解片段的區分標志。miRNA 5'端第一個鹼基對U(尿苷)有強烈的傾向性,而對G卻排斥,但第二到第四個鹼基缺乏U。一般來講,除第四個鹼基外,其他位置鹼基通常都缺乏C。這些分子能夠與那些和它的序列互補的mRNA分子相結合,有時候甚至可以與特定的DNA片斷結合。這種結合的結果就是導致基因的沉默。這種方式是身體調節基因表達的一個重要策略。據推測,miRNA調節著人類三分之一的基因。 你可以去生物幫那裡了解這類信息,在生物幫可了解最新國內外生物動態、科研資訊、產業資訊,觀點評論和訪問生物名人博客等。 please click to connect www.bio1000.com/zt/rna/221892.html .that can help you microRNA - 選擇方法 1.pre-miRNA是最早採用的microRNA,擁有大量的成功報道。化學合成的pre-miRNA制備快捷,可以標記熒光等追蹤。缺點是制備的RNA穩定性較差,而且,由於制備的microRNA較長,合成時RNA的錯誤難以避免(當合成RNA超過60bp時,出現一個鹼基錯誤率約30%),轉錄制備的pre-miRNA穩定性較好,但無flank結構,很少使用。質粒載體形式的pre-miRNA也因為發現microRNA的flank對於microRNA功能和測定非常重要,現已逐漸被pri-miRNA取代。 2.人工pri-miRNA效果較pre-miRNA好,也有足夠多的成功使用的經驗報道,但這種人工microRNA採用固定的mir155 flank,制備的microRNA功能不及天然原始microRNA,故也逐漸較少使用。 3.原始天然pri-miRNA克隆自天然文庫的microRNA由於保留了每個microRNA獨自的原始天然雙臂結構,效果更好,是近來被首選方法。 4.pre-miRNA或pri-miRNA腺病毒:可以轉染大多數絕細胞,產品質量可靠。缺點是腺病毒有一定的毒性,以往實驗腺病毒毒性並未引起重視,但我們發現在microRNA實驗中顯得比較突出。另外,制備周期長,費用高也是不容忽視的缺點。 5.慢病毒microRNA:目前最好的microRNA實驗產品,缺點是慢病毒自身的不足,即制備lenti-virus時,病毒的質量批間差異較大。 AAV、或retrovirus microRNA:與腺病毒和lenti-virus microRNA一樣,具有病毒產品的優勢與缺點。 There are several approaches that can be used to determine where specific microRNAs are expressed in a given tissue. Northern blots, microRNA microarrays, and in situ methods such as sensors. In the figure above, a transgenic mouse was created where the lacZ gene is expressed throughout all tissues in the animal, thus the embryo stains almost entirely blue (see above, c). If specific microRNA target sites are placed in the 3"-UTR of the lacZ gene (see above, b), no blue stain will occur if that specific microRNA is present in the same tissue (see below) read the paper by Mansfield et al. .The staining pattern in the mouse embryos above is Hox-like because the miR-10 and miR-196 Hox genes are located in Hox-clusters and are expressed in a manner that is overall consistent with their relative locations in the Hox cluster (see figure below). We use sensors to detect the specific expression of microRNAs in tissues, and are developing newer approaches to follow expression in more sensitive ways-- even in alt mouse tissues. We hope these new tools will give us insight into the function of microRNAs, and perhaps their potential interplay in human diseases such as cancer.

❽ 求論文:病毒中核算在分子生物學中的應用

【綜述】
幾種用於發現未知病毒核酸序列的技術及其應用
翁康生
病毒是引發人類傳染性疾病的主要病原體之一, 它們極
大地威脅著人類健康。目前還存在人類尚未認知或新出現的
病毒, 隨時可能嚴重危害人類健康安全〔1 - 3〕。及早地發現,
鑒別未知的或新出現的病毒, 是有效的預防和控制的先決條
件之一。因此, 建立、儲備、改良、發展、乃至創新應用於
發現、鑒別未知或新出現病毒的技術方法是十分必要的。
近20 多年來, 常採用傳統的微生物學技術方法和現代分
子生物學技術方法相結合的途徑, 發現和鑒別未知病毒。通
過細胞培養的方法分離病毒、電鏡觀察、用已知病毒的抗血
清建立的免疫學方法作排他性檢測、用已知病毒核酸序列建
立的PCR、雜交等方法, 作特異核酸序列的檢測、用分子生物
學技術獲得未知病毒核酸序列, 查詢基因資料庫, 檢出並確
定未知病毒基因組序列, 最終發現鑒別出未知病毒。
對於無法用細胞分離培養的未知病毒, 有的採用免疫學
與分子生物學技術相結合, 篩選獲取病毒特異抗原編碼基因
的克隆, 進而發現鑒別出該病毒。更多的則是採用相應的分
子生物學技術, 從被檢樣品中發現獲取未知病毒的核酸序列,
進而發現鑒別未知病毒。無論未知病毒是否可以用細胞培養
分離, 最終對其基因組序列的測定分析, 是鑒別和判斷的決
定性依據之一, 而獲取未知病毒的核酸序列是前提條件。
從少量樣品中, 從高度復雜的宿主細胞核酸物質中, 分
離、擴增、獲取足夠量的無基因序列資料的未知病毒的核酸
片段, 供進一步克隆、測序、生物信息學分析, 是用分子生
物學技術發現、鑒別未知和新出現病毒的關鍵之一〔4〕, 也是
最終測定分析, 拼接出未知和新出現病毒基因組序列的瓶頸
步驟。病毒所攜核酸物質有DNA 和RNA 之分, 可採用的技術
方法也有所不同, 現將有關技術與其應用作一簡介, 以供
參考。
1 代表性差異分析法
代表性差異分析法是為尋找分析兩個生物樣品復雜的基
因組間有何差異而發展建立起來的分子生物學技術方法, 並
不斷得到演化, 發展和應用。病毒感染宿主細胞後, 與未感
染的同類細胞相比, 二者核酸物質間的差異主要在於是否存
在病毒核酸。消減去二者核酸間相同序列的背景部分, 擴增、
比較、選取餘下可能存在差異的部分, 進一步分析以發現未
知病毒的核酸序列。病毒的核酸結構各有不同, 可選用相應
的代表性差異分析法, 見表1 。
111 DNA 代表性差異分析法(DNA Representation difference
analysis , DNA RDA)
此方法是Lisitsyn 等〔5〕利用核酸消減雜交技術〔6〕、PCR 方法
和雙鏈DNA 熱變性後互補鏈退火復性的二級動力學原理〔7 - 8〕
作者單位:上海市疾病預防控制中心 200336
表1 病毒核酸類型與各代表性差異分析法的選用
病毒核
酸類型
DNA RDA c DNA RDA
非rRNA 序列
6 核苷酸引導
c DNA RDA
ds DNA 線狀√
ds DNA 環狀√
ss RNA polyA( + ) √
ss RNA polyA( - ) 3 √
ds RNA polyA( - ) √
3 負鏈ss RNA polyA( - ) 視病毒在宿主細胞的轉錄機制而定。
而建立的。方法中將需分析的樣品DNA(Test DNA ,T- DNA) 和
對照DNA(Driver DNA ,D - DNA) 設為二組,分別用同一種限制
性內切酶酶切處理,並接上5′端去磷酸化的人工接頭,補齊接
頭後,加入與接頭序列互補的引物作PCR 擴增。切除擴增產物
上的人工接頭後,切出的T - DNA 連上第二種人工接頭,變性
後與過量的變性D - DNA 雜交。通過雜交,消減去T- DNA 中
與D - DNA 中同源的核酸序列,而只存在於T - DNA 中的靶序
列DNA(Target DNA) 則自我退火復性,其兩端連有第二種人工
接頭。加入與第二種接頭互補的引物作PCR ,只有靶序列DNA
呈指數擴增,因而得到進一步富集。進過如此重復的幾個輪回
後,以電泳檢測比較T- DNA 和D - DNA ,將T- DNA 中呈現的
差異部分作分離,克隆,序列分析。
Lisitsyn 等以10μg 人淋巴細胞基因組DNA 作為D - DNA ,
在相同的人DNA 中加入相當於單拷貝量的120 pg 腺病毒DNA
作T- DNA。以此作為實驗模型,用DNA 代表性差異分析法成
功的尋找、鑒定出外加入的腺病毒DNA 序列。應用此技術,
Chang 等〔9〕在艾滋病相關的卡波西肉瘤(Kaposis Sarcoma) 中發現
一段類似人類皰疹病毒的基因, 並由此發現一種新的病毒
HPV8。以後人們又以此技術發現鑒定了HPV6、TTV 病毒、黃熱
病毒樣基因組、MDV 等〔10 - 13〕DNA 病毒。
112 cDNA 代表性差異分析法(cDNA Representation difference
analysis , cDNA RDA)
Hubank 等〔14〕針對mRNA 所含序列相對簡單的特點,提出
了cDNA 代表性差異分析法。它的基本原理與DNA RDA 相同,
主要不同在於,採用識別4 核苷酸序列的限制性內切酶,它的
識別位點在mRNA 反轉錄成的cDNA 中出現的頻率更高,平均
酶切片段長度約256 bp ,保證了cDNA 序列群中絕大多數序列,
至少被切出一個片段可擴增,供差異分析,分離鑒定。
cDNA RDA 技術相對經濟,可高效靈敏地用於非常少的起
始材料而獲得結果〔15〕。具有polyA( + ) - RNA 病毒,其核酸可
類似於mRNA 分離純化,因此可應用此技術。利用cDNA RDA
技術,發現鑒定了TiV、MenV ,等〔16 ,17〕RNA 病毒。
113 非rRNA 序列6 聚核苷酸引導反轉錄的cDNA RDA
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polyA( - ) - RNA 病毒,其核酸物質不似於mRNA ,需和宿
主細胞總RNA 同時分離,並用隨機引物作反轉錄。因為宿主細
胞總RNA 中rRNA 約佔80 % ,由於競爭反應、靶序列信號被湮
滅等原因,從這樣的總RNA 抽提物中,用隨機6 聚核苷酸引物
引導反轉錄的cDNA RDA 技術,發現鑒別polyA( - ) - RNA 病
毒核酸序列是困難的。Endoh 等〔18〕羅列了6 聚核苷酸所有可
能的排列組合,共計4 096 個序列模式,以大鼠18S、518S、28S 等
rRNA、微衛星重復序列、SARS - CoV、BI - 3 病毒等的序列數據
為模型,篩選出在rRNA 序列中出現頻率極低或不出現的6 聚
核苷酸序列模式共96 種。將這些序列分別合成並混合後,稱
之為非rRNA 序列6 聚核苷酸引物。生物信息學分析96 種序
列模式在哺乳動物病毒科具代表性的1 791 個病毒基因組序列
中出現的頻率,數據表明,非rRNA 序列6 核苷酸引物可引導絕
大多數病毒的cDNA 合成。分別用非rRNA 序列6 聚核苷酸引
物和隨機6 核苷酸引物作cDNA 反轉錄效率、cDNA RDA 試驗,
結果表明,二類引物對人工合成的RNA (二類引物在其序列中
出現的頻率相似) 反轉錄效率幾乎相等,而前者對細胞總RNA
反轉錄效率遠低於隨機引物。用二類引物作cDNA RDA ,檢測
人工合成的RNA ,前者靈敏度是用隨機引物的30 倍。在模擬
實驗中用非rRNA 序列6 聚核苷酸引物引導反轉錄,串聯cDNA
RDA 技術,檢測鑒別出感染細胞的BI - 3 和SRAS - Cov 核酸序
列片段。
此方法能從1μg 總RNA 中檢測出3 ng 的外來RNA ,其檢
測靈敏度不及普通的PCR 檢測方法,但對於檢測鑒別在宿主細
胞中復制,但不知其基因序列的poly A( - ) - RNA 病毒而言,也
是一個可選擇的方法。
114 抑制消減雜交
cDNA RDA 技術結合消減雜交和PCR 抑製作用〔19〕的技術
原理,Diatchenks 等〔20〕等發展出了抑制消減雜交技術( suppression
subtractive hybridization ,SSH) 。與前兩種RDA 技術不同點在於,
SSH 技術將內切酶酶切處理的T - cDNA 分為兩份,分別接上
不同序列的去磷酸化的接頭1 和2 ,分別於過量的D - cDNA
作第一輪雜交。雜交過程中兩組中的單鏈T - cDNA 濃度趨
同,T- cDNA 中的非靶序列單鏈cDNA 與D - cDNA 中相應序列
形成雜交雙鏈而被消減, T - cDNA 中差異表達的單鏈cDNA
被顯著富集。合並一輪雜交物,加入過量變性D - cDNA ,作第
二輪雜交。合並的二組份一輪雜交物中剩下的趨同化、經消減
雜交後的單鏈T - cDNA 能互補雜交, 可以形成: 原組內
T- cDNA 單鏈間的雜交、T - cDNA 與D - cDNA 單鏈間的雜
交、二組間T- cDNA 單鏈間的雜交。補齊雜交反應後雙鏈cD2
NA 末端,用分別與接頭1 和2 的外側部分序列互補的寡核苷
酸為引物,作PCR 擴增。二組份間T- cDNA 互補單鏈雜交物,
因兩端分別具有接頭1 和2 ,可被指數擴增;T - cDNA 與D -
cDNA 雜交物和剩餘單鏈T- cDNA ,因一端具接頭序列,被線性
擴增;而同組間T- cDNA 雜交物兩端具反轉重復長序列,因抑
制性PCR 效應,在PCR 反應循環中分子內退火形成穩定的「鍋
柄結構」〔19〕而不被擴增。因此,SSH 技術通過二輪消減雜交和
抑制性PCR 特異擴增,使假陽性大大降低,提高了檢出低豐度
靶mRNA 的靈敏度。
Hu 等〔21〕應用SSH 技術,結合反轉錄酶的模板切換(tem2
plate - switching) 功能, 以HCV RNA 陽性血清體外感染的人
MOLT- 4 急性淋巴母細胞白血病T 細胞系為模型,通過反轉錄
合成全長cDNA、抑制性消減雜交、消減的cDNA 文庫構建、反相
斑點雜交篩選,在被篩的96 個克隆里,T- cDNA 探針雜交呈特
異陽性的16 克隆中,序列分析後得到4 個插入HCV 序列的
克隆。
2 非特異多重引導滾環式擴增法
乳頭瘤病毒、痘病毒等,其基因物質為環狀DNA 分子。在
事前未知基因序列的情況下,發現和鑒別這類病毒核酸序列還
可選擇非特異多重引導滾環式擴增法(multiply primed rolling -
circle amplification ,RCA) ,擴增、分離、獲取其基因片段供進一步
分析。
自然狀況下,環狀DNA 經常以滾環方式進行復制。Dean
等〔22〕應用隨機6 聚核苷酸作引物,加入φ29 DNA 聚合酶,以質
粒DNA 和噬菌體DNA 為模型,建立了多重引物引導的滾環式
擴增法。φ29 DNA 聚合酶可長距離( > 70 000 nt) 地結合於DNA
模板,進行鏈置換DNA 合成。而隨機6 聚核苷酸引物可多位
點的與單鏈環狀DNA 互補復性。在φ29 DNA 聚合酶作用下,
以隨機引物引導,合成與模板互補的DNA 鏈。當合成鏈延伸到
與模板結合的隨機引物5′端時,在φ29 DNA 聚合酶的鏈置換活
性作用下,下游被延伸的隨機引物鏈被「甩」出模板。而上游的
延伸鏈繼續在環狀模板上復制合成。同時,被從單鏈環狀模板
上「甩」出的互補鏈,又成為新的模板,隨機引物與之結合,在
φ29 DNA 聚合酶作用下,繼續以枝杈的形式進行鏈延伸和鏈置
換,最後以雙鏈DNA 串聯體形式釋放。用此法可使1 ng 純
pCU18 環狀DNA 模板延展式地擴增至107倍。
Rector 等〔23〕以此原理建立了不依賴已知的特定基因序列
(非序列依賴性) 的多重引導滾環式擴增環狀DNA 病毒基因組
方法,並應用其擴增獲取了HPV 16 的基因組DNA。在接近實
樣的試驗樣品中,由於稀釋倍數和環狀DNA 分子較大等原因,
將HPV 16 基因組DNA 擴增了214 ×104 倍。
3 病毒顆粒相關核酸的非序列依賴性PCR 擴增
病毒核酸可包裹於病毒外殼內,病毒的蛋白外殼或脂膜對
病毒核酸具有保護作用。而病毒顆粒具有不同於細菌或其他
真核細胞的理化特性。利用這樣的特點Allender 等〔24〕和Stang
等〔25〕各自建立了病毒顆粒相關核酸的非序列依賴性PCR 擴增
方法(sequence - independent amplification) 。兩種方法的共同點在
於,依據病毒顆粒小、具一定密度,用0122μm 濾器過濾、或再串
上超速密度梯度離心,從樣品中分離出病毒顆粒,DNA 酶酶解
游離的DNA ,裂解病毒顆粒,抽提獲取較純的病毒顆粒相關
核酸。
Allender 等〔24〕借鑒RDA 原理,對病毒顆粒相關核酸用限制
性內切酶酶切後,作非序列依賴性單引物PCR 擴增( sequence -
independent single primer amplification ,SISPA) :將抽提獲取的DNA
或RNA 分別補齊,合成第二鏈DNA ,或反轉錄,合成雙鏈cDNA。
限制性內切酶酶切後,酶切片段兩端連接一種接頭,並以與接
頭同序列的單一寡核苷酸為引物,作PCR 擴增。擴增產物進一
步克隆與序列分析。用此法檢驗HBV 陽性血清和GBV - B 陽
性血清樣品,結果在相當於106/ ml 個基因組拷貝濃度的50μl
樣品中,可重復試驗檢出相應的病毒基因片段。
Stang 等〔25〕則在得到雙鏈DNA 或雙鏈cDNA 後加入k - 隨
機引物,此種引物5′端含有20 個固定序列的核苷酸,3′端則有
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MNNMNM6 核苷酸隨機簡並序列。與變性模板退火時,6 核苷
酸隨機簡並序列隨機地與模板相應序列互補退火,在T4 DNA
聚合酶作用下作鏈延伸。然後在延伸產物中加入k - 隨機引物
中固定序列部分的20 寡核苷酸作引物,進行PCR 擴增。擴增
產物電泳分析、克隆、測序。用此方法檢驗由實時- PCR 定量,
包括病毒顆粒相關核酸及游離核酸在內的病毒基因組拷貝數
為109/ ml 的Cox - 3 和MAV - 1 培養物。前者的12 克隆中,
9 個克隆插入有腸道病毒的四個不同區域的同源基因片段;而
6 個MAV - 1 中分離的克隆內,5 個含有99 % 同源MAV - 1 基
因片段。
基於病毒顆粒分離純化、DNase 處理、病毒顆粒相關核酸的
非序列依賴性PCR 擴增,獲取、鑒定未知病毒的基因片段,盡管
靈敏度不夠高,但其實驗時間較短,步驟相對簡單,對於病毒拷
貝數高,時間緊急的樣品鑒別,是較適宜的一套方法。
病毒的種類、結構、特性多種多樣,感染病毒後需要檢驗的
樣品又各不相同,因此用於發現鑒別未知病毒的核酸序列的技
術,也不是固定不變和完全通用的。以上的技術方法各有優缺
點和適用范圍。而針對擴增獲取未知病毒基因組序列片斷,這
一發現鑒定未知病毒的分子生物學技術的要點或瓶頸,必然還
會有新的改進、創新技術出現,將會更快、更靈敏、更簡便、更准
確的發現鑒別未知病毒。
參 考 文 獻
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